Да, после обновления конфигурации 1С рекомендуется выполнить повторную публикацию базы на веб-сервере. Это связано с тем, что обновление конфигурации может изменить структуру и логику работы базы, а также файлы, которые обслуживает веб-сервер (например, web-сервисы, http-сервисы, веб-клиент). Повторная публикация обновляет конфигурационные файлы веб-сервера, модули расширения и другие компоненты, обеспечивая корректную работу обновленной конфигурации через веб-клиент.

Если публикация не будет выполнена, возможны ошибки доступа, некорректное отображение данных или сбои в работе web- и http-сервисов 1С.

Рекомендуемый порядок действий после обновления конфигурации:

1. Завершить работу пользователей (монопольный режим).
2. Обновить конфигурацию базы.
3. Выполнить повторную публикацию базы на веб-сервере (через утилиту webinst или вручную).
4. Перезапустить веб-сервер (например, systemctl restart httpd).
5. Разрешить работу пользователей.

Таким образом, повторная публикация — обязательный этап для корректной работы обновленной базы 1С через веб.

Рекомендую посмотреть здесь:
https://1s-on.ru/publikacziya-1s-na-veb-servere-linux/
https://infostart.ru/1c/articles/165167/