Рекомендую делать все доработки, связанные с одним объектом конфигурации (например, документом), в одном расширении, а не дробить изменения по разным расширениям. Вот почему:

1. **Упрощение сопровождения и поддержки**
Если для каждого документа создавать отдельное расширение, то при необходимости внести изменения в один документ придется работать с несколькими расширениями, что усложняет управление и отладку.

2. **Порядок применения расширений**
Расширения применяются в порядке их добавления, изменить этот порядок сложно и затратно. Если логика в разных расширениях зависит друг от друга, могут возникнуть конфликты и непредсказуемое поведение.

3. **Избежание конфликтов и дублирования**
Объединение изменений по одному объекту в одном расширении снижает риск конфликтов между расширениями и дублирования кода.

4. **Простота обновления и тестирования**
Одно расширение на объект легче тестировать и обновлять, чем несколько, особенно если изменения связаны между собой.

5. **Рекомендация по функциональному объединению**
Если изменения по разным документам логически связаны (например, одна бизнес-логика), можно объединять их в одно расширение по функциональному признаку, а не по объектам.

6. **Программное изменение форм**
Все изменения форм лучше делать программно (например, в обработчиках событий формы), а не через редактор форм, чтобы избежать проблем при обновлениях.

Итого:
- Для каждого документа — одно расширение, если изменения независимы.
- Если изменения по разным документам связаны по функционалу — объединяйте в одно расширение.
- Не дробите расширения без необходимости.

Это позволит избежать проблем с порядком применения расширений, упростит сопровождение и обновление.

Рекомендую посмотреть здесь:
https://infostart.ru/1c/articles/1039552/
https://infostart.ru/1c/articles/2033431/